Los objetivos del IUTLA, se sustentan sobre la base de su Misión y Visión, de las fortalezas que tiene como universidad que se encuentra en zona privilegiada de frontera, mantiene los siguientes objetivos estratégicos:
- Desarrollar e incrementar, de forma sostenible, la función académicaal más alto nivel y acorde a los desafíos y necesidades del país y de la sociedad en general.
- Contribuir sistemáticamente al desarrollo del pensamiento crítico y el fortalecimiento científico del conocimiento con miras al diagnóstico y diseño de soluciones de los problemas estratégicos del país.
- Fortalecer el Instituto de manera integrada y equilibrada, culturalmente inclusiva, pluralista, en el marco del respeto y bienestar de la Comunidad Universitaria y del contexto que la rodea.
- Impulsar una internacionalización que responda a los nuevos desafíos regionales y globales.
- Mejorar sustentablemente la gestión académica y financiera en función de los objetivos académicos establecidos.